СтГАУ занимает в общем рейтинге — 1501-1750. Значимо, что вуз завоевал второе место среди всех университетов, подведомственных Министерству сельского хозяйства РФ.

Московский международный рейтинг «Три миссии университета» оценивает все три ключевые функции вуза: образование (первая миссия), науку (вторая миссия) и взаимодействие с обществом (третья миссия). Это не просто академический список. Его формирование в 2016 году было инициировано Российским Союзом Ректоров по поручению Президента России В. В. Путина. На сегодняшний день это единственный рейтинг, который официально учитывается на государственном уровне:

•     При мониторинге национального проекта «Наука и университеты».

•     При признании в России ученых званий и степеней, полученных в зарубежных университетах.

Важной особенностью методологии является ее полная объективность: оператор рейтинга, агентство RAEX, не использует анкетирование и опросы, а оценивает вузы исключительно по данным из внешних проверенных источников.

В 2025 году в рейтинг вошли 2000 университетов из 112 стран мира, в том числе 156 от России (из всех федеральных округов).

Лучший результат среди российских вузов по-прежнему демонстрирует МГУ им. М. В. Ломоносова, сохранивший 17-е место в топ-2000.

В масштабах Северо-Кавказского федерального округа (СКФО) дебют университета стал частью общего прорыва: Чеченский государственный университет также впервые вошел в рейтинг. При этом Ставропольский ГАУ показал наивысший результат среди «дебютантов» округа.